Distintas formas para manipular un checkBox con Jquery.

$(".chkFormulario").attr('checked',false);
Permite modificar el atributo de checkeado. Tambien se puede modificar otros atributos de este control, solo debe ser indicado entre comillas simple y el valor que necesitamos que tenga.

Ej:
$(".chkFormulario").attr('value','NuevoValorModificadoPorJQuery');

$(".chkFormulario").is(':checked')
Permite saber si el checkbox esta "checkeado" o no.
Ej:
        if($(".chkFormulario").is(':checked'))
            $(".chkFormulario").attr('checked',false); //Si esta marcado se desmarca
        else
            $(".chkFormulario").attr('checked',true);